1644年清世祖顺治元年藏历第十一饶迥木猴年
西藏使者戴青曲杰等返回拉萨，带来清朝皇帝的书信和礼品。清军入关。消息传到拉萨，固始汗、五世达赖喇嘛、四世班禅等遣使到北京祝贺清朝顺治皇帝登上中原的皇位。
1645年清世祖顺治二年藏历第十一饶迥木鸡年
因林麦曲杰·官却群培等人的建议，五世达赖喇嘛决定动工兴建布达拉宫。当年为布达拉宫举行奠基仪式。
1647年清世祖顺治四年藏历第十一饶迥火猪年
五世达赖喇嘛著《诗镜论释难妙音欢歌》。蒙藏联军进攻不丹，先胜后败，约和而还。
1648年清世祖顺治五年藏历第十一饶迥土鼠年
布达拉宫的白宫部分建成。
1649年清世祖顺治五年藏历第十一饶迥土牛年
赞布诺们罕·顿珠嘉措兴建青海敏珠尔寺（广慧寺）。
1652年清世祖顺治九年藏历第十一饶迥水龙年
3月，五世达赖喇嘛从拉萨启程进京朝见，于年底到达北京。
1653年清世祖顺治十年藏历第十一饶迥水蛇年
年初，五世达赖喇嘛离京返藏，行至岱海时，顺治皇帝遣使册封五世达赖喇嘛为“西天大善自在佛普通瓦赤拉怛喇达赖喇嘛”，赐金册、金印。顺治皇帝还派使臣与五世达赖喇嘛一起入藏，册封固始汗为“遵行文义敏慧固始汗”，赐金册、金印。7月，仲麦巴·桑结嘉措生于拉萨北郊的娘真地方。
1654年清世祖顺治十一年藏历第十一饶迥木马年
12月，固始汗在拉萨去世。
1658年清世祖顺治十五年藏历第十一饶迥火猴年
1月，固始汗之子达延汗在拉萨继承汗位。3月，第巴索南饶丹去世。
1659年清世祖顺治十六年藏历第十一饶迥土猪年
十世噶玛巴黑帽系活佛却英多吉从云南丽江派人到北京，向清朝皇帝进贡。
1660年清世祖顺治十七年藏历第十一饶迥铁鼠年
7月，五世达赖喇嘛和达延汗任命仲麦巴·赤列嘉措为第巴。顺治皇帝派使者到云南，赐给却英多吉敕书和印章。
1662年清圣祖康熙元年藏历第十一饶迥水虎年
四世班禅·洛桑却吉坚赞圆寂。五世达赖喇嘛的弟子霍尔曲杰·阿旺平措在康区甘孜地方创建甘孜扎西雪珠诺布林寺（即甘孜寺），他相继在康区建立格鲁派十三座寺院，称为霍尔十三寺。
1663年清圣祖康熙二年藏历第十一饶迥水兔年
五世班禅·洛桑意希在后藏托卜加地方出生。
1668年清圣祖康熙七年藏历第十一饶迥土猴年
2月，第巴仲麦巴·赤列嘉措去世，3月，达延汗去世。
1669年清圣祖康熙八年藏历第十一饶迥土鸡年
8月，五世达赖喇嘛任命罗桑图道为第巴。
1670年清圣祖康熙九年藏历第十一饶迥铁狗年
3月，达延汗之子达赖汗在拉萨继承汗位。
1673年清圣祖康熙十二年藏历第十一饶迥水牛年
五世达赖喇嘛著《受法录－恒河水流》、《尺牍指南明镜》。按照清朝皇帝的旨意，十世噶玛巴黑帽系活佛却英多吉和在云南出生的六世噶玛巴红帽系活佛的转世灵童回到拉萨，五世达赖喇嘛会见了他们，由此噶玛噶举派和格鲁派消除敌对，相安无事。
1674年清圣祖康熙十三年藏历第十一饶迥木虎年
五世达赖喇嘛著《珍珠树格言》。
1675年清圣祖康熙十四年藏历第十一饶迥木兔年
东托巴·白玛仁增在德格建佐钦寺。7月，五世达赖喇嘛打算任命仲麦巴·桑结嘉措为第巴，仲麦巴·桑结嘉措以自己年纪太轻为由推辞，五世达赖喇嘛任命洛桑金巴为第巴。
1676年清圣祖康熙十五年藏历第十一饶迥火龙年
德达林巴建扎囊敏珠林寺。五世达赖喇嘛以夏鲁哇钦波为师重新受喀且班钦戒统的比丘戒。并给许多人重新传授比丘戒。
1679年清圣祖康熙十八年藏历第十一饶迥土羊年
1月，洛桑金巴辞去第巴职务，2月，五世达赖喇嘛任命仲麦巴·桑结嘉措为第巴。西藏与拉达克发生战争。桑结嘉措制定《十二法》。
1680年清圣祖康熙十九年藏历第十一饶迥铁猴年
五世达赖喇嘛命其弟子梅热喇嘛在门达旺地区兴建达旺寺，成为该地的宗教和行政中心。
1681年清圣祖康熙二十年藏历第十一饶迥铁鸡年
第巴桑结嘉措著《法律文书－水晶鉴》。蒙藏军在拉达克取得战争胜利。
1682年清圣祖康熙二十一年藏历第十一饶迥水狗年
2月，五世达赖喇嘛·罗桑阿旺嘉措在布达拉宫圆寂，第巴桑结嘉措决定实行匿丧，自己以五世达赖喇嘛的名义处理政教事务。
1683年清圣祖康熙二十二年藏历第十一饶迥水猪年
3月，六世达赖喇嘛仓央嘉措生于门达旺地区。康熙皇帝下令在北京刻印藏文大藏经《甘珠尔》，1724年雍正皇帝又下令在北京刻印藏文大藏经《丹珠尔》，合称康熙版藏文大藏经，亦称北京版西藏大藏经。
1685年清圣祖康熙二十四年藏历第十一饶迥木牛年
第巴桑结嘉措写成历算著作《白琉璃》。
1686年清圣祖康熙二十五年藏历第十一饶迥火虎年
第巴桑结嘉措派人秘密认定仓央嘉措为五世达赖喇嘛的转世，安置在措那宗居住。
1688年清圣祖康熙二十七年藏历第十二饶迥土龙年
第巴桑结嘉措写成藏医著作《蓝琉璃》。并命洛扎·诺布嘉措等人将《蓝琉璃》的内容绘成60幅唐卡画。
1690年清圣祖康熙二十九年藏历第十二饶迥铁马年
第巴桑结嘉措主持建成布达拉宫的红宫部分。
1694年清圣祖康熙三十三年藏历第十二饶迥木狗年
康熙皇帝封第巴桑结嘉措为“掌瓦赤喇怛喇达赖喇嘛教弘宣佛法王”，并赐金印。第巴桑结嘉措在康熙皇帝的责问下，为五世达赖喇嘛发丧，在布达拉宫内为五世达赖喇嘛兴建灵塔。并于次年为灵塔举行开光仪式。
1697年清圣祖康熙三十六年藏历第十二饶迥火牛年
第巴桑结嘉措向康熙皇帝奏报寻访五世达赖喇嘛的转世灵童的情形，经康熙皇帝同意后，5月，迎请转世灵童到浪卡子，以五世班禅为师受沙弥戒。10月，六世达赖喇嘛在布达拉宫坐床。康熙皇帝派二世章嘉活佛到拉萨看视转世灵童坐床。此即六世达赖喇嘛·仓央嘉措。青海蒙古各部首领由固始汗幼子达什巴图尔率领进京觐见，康熙皇帝封达什巴图尔为和硕亲王。
1698年清圣祖康熙三十七年藏历第十二饶迥土虎年
第巴桑结嘉措著《格鲁派教法史——黄琉璃》。
1701年清圣祖康熙四十年藏历第十二饶迥铁蛇年
达赖汗在拉萨去世，其子拉藏汗继承汗位。
1704年清圣祖康熙四十三年藏历第十二饶迥木猴年
康熙皇帝派侍卫拉锡等到青海，探访黄河河源。洛扎·诺布嘉措等人根据《月王药诊》等书补绘，完成79幅全套医药唐卡画。
1705年清圣祖康熙四十四年藏历第十二饶迥木鸡年
第巴桑结嘉措与蒙古和硕特部汗王拉藏汗发生冲突，虽经三大寺扎仓堪布等调解，达成第巴桑结嘉措让出第巴职务给其儿子阿旺仁钦、拉藏汗离西藏去青海的协议，但是双方都未认真履行，召集部下再战，第巴桑结嘉措兵败被杀。清朝停止在甘青地区以茶易马事务。
1706年清圣祖康熙四十五年藏历第十二饶迥火狗年
六世达赖喇嘛·仓央嘉措被拉藏汗废黜，解送北京，行至青海湖边时去世。拉藏汗立阿旺意希嘉措为达赖喇嘛，拉萨三大寺部分僧人和青海蒙古一些首领不满拉藏汗废黜六世达赖喇嘛·仓央嘉措，不承认阿旺意希嘉措是五世达赖喇嘛的转世。
1709年清圣祖康熙四十八年藏历第十二饶迥土牛年
一世嘉木样活佛·阿旺尊追在甘南夏河建拉卜楞寺。青海蒙古众首领向康熙皇帝上奏，声称在理塘找到六世达赖喇嘛·仓央嘉措的转世灵童，请求康熙皇帝批准承认理塘的灵童为达赖喇嘛。
1713年清圣祖康熙五十二年藏历第十二饶迥水蛇年
康熙皇帝封五世班禅·洛桑意希为“班禅额尔德尼”，并赐诏书、金印。
1717年清圣祖康熙五十六年藏历第十二饶迥火鸡年
卫拉特蒙古准噶尔部首领策妄阿拉布坦与拉藏汗联姻，派兵以送女婿、女儿赴藏为名，偷袭西藏，并以送真达赖喇嘛到西藏为号召，鼓动西藏僧俗反对拉藏汗。准噶尔军攻破拉萨，击杀拉藏汗，废黜拉藏汗所立的达赖喇嘛阿旺意希嘉措。准噶尔军入藏后，强征供养，毁敏珠林寺等寺院，杀戮僧俗，引起许多官员百姓的反抗，康济鼐、颇罗鼐等人在阿里、后藏起兵，阿尔布巴等人在工布起兵，反抗准噶尔军。章嘉·若必多吉在甘肃天祝出生。
1718年清圣祖康熙五十七年藏历第十二饶迥土狗年
康熙皇帝命额伦特率兵数千入藏驱逐准噶尔军，行至藏北那曲，与准噶尔军交战，全军覆没。多喀夏仲·次仁旺杰著小说《宣努达美》。
1719年清圣祖康熙五十八年藏历第十二饶迥土猪年
康熙皇帝封察雅切仓活佛为呼图克图。
1720年清圣祖康熙五十九年藏历第十二饶迥铁鼠年
康熙皇帝派皇十四子到青海塔尔寺，封青海蒙古首领承认的格桑嘉措为达赖喇嘛，此即七世达赖喇嘛·格桑嘉措。清军在青海蒙古各部的配合下，由都统延信率兵进军西藏，护送格桑嘉措到拉萨坐床。
1721年清圣祖康熙六十年藏历第十二饶迥铁牛年
清军抵拉萨，康熙皇帝封康济鼐为贝子，与阿尔布巴、隆布鼐共同掌管西藏政务。卓尼土司玛索公保出资刻印藏文大藏经甘珠尔。青海蒙古亲王罗卜藏丹津发动反清之乱。
1724年清世宗雍正二年藏历第十二饶迥木龙年
清朝在平定罗卜藏丹津反清之乱后，制定“青海善后事宜十三条”和“禁约青海十二事”，正式设立“钦差办理青海蒙古番子事务大臣”，即西宁办事大臣。雍正皇帝赐给七世达赖喇嘛金册、金印，封颇罗鼐、扎尔鼐为台吉，封七世达赖喇嘛之父为公爵。因雍正皇帝之命，章嘉·若必多吉被清军送到北京。
1726年清世宗雍正四年藏历第十二饶迥火马年
清朝派员在青海湖南岸召集青海蒙藏各部首领会盟祭海，清查蒙藏各部人口，划分青海蒙古为29旗，各旗设扎萨克管理，藏族部落设置千户、百户管理。清朝又命都统鄂齐、四川提督周瑛、云南提督郝玉麟等划分四川、云南、西藏地界，宁静山以东属四川，宁静山以西属西藏，宁静山以南中甸、迪庆等地属云南。
1727年清世宗雍正五年藏历第十二饶迥火羊年
西藏统治集团内部发生内争，阿尔布巴、隆布鼐、扎尔鼐合伙杀害康济鼐，颇罗鼐逃到后藏，前后藏发生战乱。清朝派大臣驻藏办事。
1728年清世宗雍正六年藏历第十二饶迥土猴年
颇罗鼐战胜阿尔布巴等，进入拉萨。清军到拉萨后，处死阿尔布巴等，命颇罗鼐掌管西藏政务。雍正皇帝下令将七世达赖喇嘛迁移到康区噶达地方，并建泰宁寺供其居住。1729年德格土司丹巴次仁建德格印经院，刻印藏文大藏经《甘珠尔》。
1733年清世宗雍正十一年藏历第十二饶迥水牛年
多喀夏仲·次仁旺杰撰写《颇罗鼐传》。
1734年清世宗雍正十二年藏历第十二饶迥木虎年
雍正皇帝派果亲王允礼和章嘉活佛·若必多吉到泰宁寺看望七世达赖喇嘛。
1735年清世宗雍正十三年藏历第十二饶迥木兔年
雍正皇帝命副都统福寿和章嘉活佛若必多吉等护送七世达赖喇嘛返回拉萨。1737年德格印经院刻印藏文大藏经《丹珠尔》，完成德格版藏文大藏经。清朝撤销西宁、洮州、河州、甘州等茶马司。
1740年清高宗乾隆五年藏历第十二饶迥铁猴年
乾隆皇帝封颇罗鼐为郡王。
1741年清高宗乾隆六年藏历第十二饶迥铁鸡年
颇罗鼐出资在纳塘寺刻印《丹珠尔》。
1744年清高宗乾隆九年藏历第十二饶迥木鼠年
乾隆皇帝命章嘉活佛·若必多吉主持，将雍正皇帝即位前的住所雍和宫改建为藏传佛教寺院，并命七世达赖喇嘛从西藏派遣僧人到雍和宫担任扎仓堪布。
1747年清高宗乾隆十二年藏历第十三饶迥火兔年
颇罗鼐去世，其子珠尔墨特那木扎勒承袭郡王爵位。
1748年清高宗乾隆十三年藏历第十三饶迥土龙年
乾隆皇帝派画师测绘布达拉宫。松巴堪布在青海佑宁寺著《如意宝树史》。
1750年清高宗乾隆十五年藏历第十三饶迥铁马年
拉萨发生珠尔墨特那木扎勒之乱，驻藏大臣傅清、拉布敦杀珠尔墨特那木扎勒，珠尔墨特那木扎勒亲信党羽杀害驻藏大臣。
1751年清高宗乾隆十六年藏历第十三饶迥铁羊年
乾隆皇帝制定“藏内善后章程十三条”，命七世达赖喇嘛掌管西藏政教。其下设立四名噶伦，办理行政事务，组成噶厦，由达赖喇嘛和驻藏大臣共同领导。
1752年清高宗乾隆十七年藏历第十三饶迥水猴年
七世达赖喇嘛新设布达拉宫译仓，作为办理达赖喇嘛文书往来的机构。
1753年清高宗乾隆十八年藏历第十三饶迥水鸡年
卓尼土司丹松才仁出资刻印藏文大藏经丹珠尔，至此完成卓尼版藏文大藏经。
1754年清高宗乾隆十九年藏历第十三饶迥木狗年
七世达赖喇嘛设立布达拉宫僧官学校。建罗布林卡的格桑颇章。康珠·丹增却吉尼玛写成著名的《诗镜论》注释《妙音语之游戏海》初稿。
1757年清高宗乾隆二十二年藏历第十三饶迥火牛年
七世达赖喇嘛去世，乾隆皇帝命第穆活佛·德勒嘉措出任摄政，派章嘉活佛·若必多吉入藏主持办理认定七世达赖喇嘛的转世灵童等事务。
1759年清高宗乾隆二十四年藏历第十三饶迥土兔年
乾隆皇帝赐给第穆活佛·德勒嘉措封诰及银印。
1779年清高宗乾隆四十四年藏历第十三饶迥土猪年
六世班禅到热河朝见乾隆皇帝，祝贺乾隆皇帝七十寿辰。
1780年清高宗乾隆四十五年藏历第十三饶迥铁鼠年
六世班禅在北京圆寂。
1787年清高宗乾隆五十二年藏历第十三饶迥火羊年
噶钦·益西坚赞著《传法上师传》。蒂尔玛·丹增平措写成藏药名著《晶珠本草》。
1788年清高宗乾隆五十三年藏历第十三饶迥土猴年
廓尔喀军侵扰后藏。
1791年清高宗乾隆五十六年藏历第十三饶迥铁猪年
廓尔喀军再次侵扰后藏，抢掠扎什伦布寺。
1792年清高宗乾隆五十七年藏历第十三饶迥水鼠年
清朝增派福康安率领大军入藏反击廓尔喀军，乾隆皇帝派人入藏管理铸造西藏钱币。
1793年清高宗乾隆五十八年藏历第十三饶迥水牛年
清军攻入廓尔喀，廓尔喀投降议和。清朝制定《钦定藏内善后章程二十九条》。
1801年清仁宗嘉庆六年藏历第十三饶迥铁鸡年
土观·却吉尼玛著《教派源流水晶鉴》。
1810年清仁宗嘉庆十五年藏历第十四饶迥铁马年
多仁·丹增班觉著《多仁班智达传》（亦译《多仁家族史》）。
1830年清宣宗道光十年藏历第十四饶迥铁虎年
按照驻藏大臣传达的旨意，噶厦派人清查西藏各地的差税负担，编写成《铁虎清册》。
1835年清宣宗道光十五年藏历第十四饶迥木羊年
波密头人抗拒交纳差税，噶厦派兵镇压。
1841年清宣宗道光二十一年藏历第十四饶迥铁牛年
森巴军进犯阿里，西藏出兵反击。
1843年清宣宗道光二十三年藏历第十四饶迥水兔年
周加巷赤列南杰著《至尊宗喀巴大师传》。
1851年清文宗咸丰元年藏历第十四饶迥铁猪年
噶伦夏扎·旺秋杰波主持修缮桑耶寺。
1862年清穆宗同治元年藏历第十四饶迥水狗年
哲蚌寺为法会布施分配发生骚乱，摄政热振活佛逃往汉地，夏扎·旺秋杰波出任摄政。
1888年清德宗光绪十四年藏历第十五饶迥土鼠年
英帝国主义者侵略帕里地区，西藏军民首次抗英战争。
1895年清德宗光绪二十一年藏历第十五饶迥木羊年
米旁嘉措著《国王修身论》。
1904年清德宗光绪三十年藏历第十五饶迥木龙年
英军侵略西藏，西藏军民在江孜英勇抵抗，终于失败。十三世达赖喇嘛逃离拉萨去外蒙古库伦，英军进入拉萨，强迫订立《拉萨条约》，共十条。
1906年清德宗光绪三十二年藏历第十五饶迥火马年
十三世达赖喇嘛从外蒙古回藏，行至青海塔尔寺奉旨停止，等候进京。中英在北京订立《中英关于西藏的第二次条约》，供八条。以1904年《拉萨条约》为“附约”。清朝任命赵尔丰为川滇边务大臣，在康定、巴塘等地实行“改土归流”。
1907年清德宗光绪三十三年藏历第十五饶迥火羊年
清朝派张荫棠进藏“查办藏事”，推行多项改良措施。
1908年清德宗光绪三十四年藏历第十五饶迥土猴年
十三世达赖喇嘛进京朝见光绪帝及慈禧太后。
1909年清宣统帝宣统元年藏历第十五饶迥土鸡年
十三世达赖喇嘛返回拉萨。
1910年清宣统帝宣统二年藏历第十五饶迥铁狗年
清朝所派川军抵拉萨，军纪很差，十三世达赖喇嘛为自身安全，逃往印度。
1911年清宣统帝宣统三年藏历第十五饶迥铁猪年
在藏川军与西藏军民冲突，拉萨形势混乱。协林巴·明久伦珠创作抒情长诗《忆拉萨歌》。
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